阴茎短小指的是成年男子阴茎疲软、勃起后其长度、粗度均小于正常男子平均值的一种疾病。也有认为，青春期前小于2.5厘米，青春期后仍不足5厘米者属小阴茎。

在很多男性的心目中，阴茎的发育代表男子的阳刚素质，阴茎大就能显示男子汉的威武气魄;阴茎小，妻子会得不到性满足，甚至会影响生育，所以对自己的阴茎发育关怀备至。然而，阴茎的大小存在着种族和个体的差异。国内史成礼测定1412例健康男青年的阴茎大小，最长的为14.5厘米，最短为4厘米，平均8.375厘米;周长最大12厘米，最小4.5厘米，平均8.3厘米。对126例阴茎勃起测量，最长16厘米，最短9厘米，平均12厘米;勃起周径最大14厘米，最小8厘米，平均10.75厘米。梁学强测量南方地区724人，最长11.5厘米，最短4厘米，平均6.94厘米。可见，每个人的阴茎大小有着明显差异，阴茎的发育和身体其他部位的发育一样，与遗传素质有密切关系。

第二性征的出现，也是判断小阴茎是生理性或病理性的重要标志。假如第二性征发育都很好，阴茎也能勃起和夜间也常有遗精现象发生，尽管在常态下不足5厘米，勃起时不超过8厘米，那么这种小阴茎也大多是生理性的正常偏小，不属于病态。